劇情架構分為三組，按照三條線路做畢業旅行：
樂樂和鬧鬧一組，去探訪水與各種生命的奇聞趣事，揭示水是生命之源，包括一滴水中的生命、為植物運送養料、幫助生物生兒育女、幫助植物孕育果實、維持生命的生存等；
晶晶和淘淘一組，去探訪水與人類生活的關系，揭示水是生產之要，包括探訪水電站、生產衣服的工廠、面包作坊、農田、建筑工地、醫院、一戶住家、自來水系統、地下排水系統等；
剛剛和奇奇一組，去探訪水與大自然生態環境的秘密，揭示水是生態之基，包括濕地的恢復、森林中的一天、沙漠中的綠洲、極地、高原等。
本集水滴學校講述水是生態之基。水在自然環境和社會環境中是極為重要而活躍的因素。水維系著生態環境系統的形成、演化和運行，是生態環境改善不可分割的保障系統。如果沒有水，湖泊干涸，河道斷流，濕地消失，會帶來巨大生態災難，影響生物的多樣性，甚至危及人類生存與發展。本集通過講述小水滴的畢業旅行闡述水是生態之基的道理，劇情如下：
大湖不哭劇情簡介
和伙伴們在學校分手后，剛剛和奇奇順著水流出了湖泊，來到一片水面比較開闊的地方。走了大半天，兩個小伙伴躺在岸邊的青苔上一邊休息，奇奇聊起了自己的家鄉，兩個小水滴決定一起去奇奇的家鄉看一看。
剛剛、奇奇來到了奇奇記憶中大湖的位置，卻怎么也找不到大湖了。
白天鵝阿姨從天而降，奇奇趕緊問大湖去哪了？
白天鵝阿姨說很多大湖的居民都離開了，她也要離開了。
奇奇和剛剛走到原先大湖的位置，現在這里是一幅沒有生機的景象。水面并不寬廣，感覺幾步就能跑到對岸。岸周圍是黑色的泥土，稀稀松松的長著幾顆東倒西歪的小草。水中的蘆葦多半的身子都裸露在外，有的已經干枯。仔細尋找，可以在渾濁并且已經有些發臭的水中看到小魚小蝦們。他們早已失去了往日的活潑，或趴在底泥上，或躺在水里，看樣子都病得不輕。
剛剛奇奇很驚訝，原本美麗的大湖怎么變成這樣了，真相，你在哪里？
奇奇跑到湖邊看到了已經暈倒的鯉魚爺爺！
救醒了鯉魚爺爺，剛剛奇奇得知，大湖病了，很多大湖中的動物也病了，原因是工廠跟各類建筑的廢水臟水把大湖污染了。
剛剛奇奇決定一定要拯救大湖，向同學們發送了信號后，鋪天蓋地的小水滴向大湖的方向匯聚而來，天空下起了雨，水中的生物得到了救治，大湖重生了。
場景1：畢業旅行去奇奇的家鄉
場景2：病了的大湖
場景3：小水滴們拯救了大湖
